Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX5

Dkc1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkc1Q9ESX5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dkc1Q9ESX5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dkc1Q9ESX5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Dkc1Q9ESX5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Dkc1Q9ESX5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms