Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESJ4

Nckipsd, NCK-interacting protein with SH3 domain, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NckipsdQ9ESJ4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NckipsdQ9ESJ4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NckipsdQ9ESJ4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NckipsdQ9ESJ4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NckipsdQ9ESJ4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NckipsdQ9ESJ4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NckipsdQ9ESJ4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NckipsdQ9ESJ4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms