Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ms4a4bQ9ES61 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a4bQ9ES61 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms