Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQS9

Igdcc4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igdcc4Q9EQS9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Igdcc4Q9EQS9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igdcc4Q9EQS9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igdcc4Q9EQS9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Igdcc4Q9EQS9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Igdcc4Q9EQS9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms