Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clca3a2Q9EQR4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clca3a2Q9EQR4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Clca3a2Q9EQR4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms