Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndst3Q9EQH7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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Ndst3Q9EQH7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ndst3Q9EQH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndst3Q9EQH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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