Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SyncQ9EPM5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SyncQ9EPM5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SyncQ9EPM5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SyncQ9EPM5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SyncQ9EPM5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms