Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Aph1cQ9DCZ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Aph1cQ9DCZ9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Aph1cQ9DCZ9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Aph1cQ9DCZ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms