Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mlst8Q9DCJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mlst8Q9DCJ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mlst8Q9DCJ1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Mlst8Q9DCJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms