Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Syde1Q9DBZ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Syde1Q9DBZ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Syde1Q9DBZ9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Syde1Q9DBZ9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms