Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tysnd1Q9DBA6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tysnd1Q9DBA6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tysnd1Q9DBA6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tysnd1Q9DBA6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tysnd1Q9DBA6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms