Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB94

Wdr53, WD repeat-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr53Q9DB94 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr53Q9DB94 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Wdr53Q9DB94 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Wdr53Q9DB94 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Wdr53Q9DB94 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms