Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
1700018B08RikQ9DA83 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
1700018B08RikQ9DA83 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
1700018B08RikQ9DA83 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
1700018B08RikQ9DA83 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
1700018B08RikQ9DA83 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms