Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9S1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9S1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Q9D9S1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Q9D9S1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Q9D9S1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9D9S1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Q9D9S1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Q9D9S1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D9S1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Q9D9S1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Q9D9S1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9S1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q9D9S1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Q9D9S1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q9D9S1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms