Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pdzd9Q9D9M4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Pdzd9Q9D9M4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdzd9Q9D9M4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzd9Q9D9M4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pdzd9Q9D9M4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
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