Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
1700109H08RikQ9D9C0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
1700109H08RikQ9D9C0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
1700109H08RikQ9D9C0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
1700109H08RikQ9D9C0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.8 ms