Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9B0

Ccdc70, Coiled-coil domain-containing protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc70Q9D9B0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc70Q9D9B0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc70Q9D9B0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc70Q9D9B0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc70Q9D9B0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms