Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AplfQ9D842 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AplfQ9D842 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 248.7 ms