Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cldn22Q9D7U6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cldn22Q9D7U6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn22Q9D7U6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn22Q9D7U6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms