Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cldn23Q9D7D7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Cldn23Q9D7D7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cldn23Q9D7D7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Cldn23Q9D7D7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn23Q9D7D7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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