Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tube1Q9D6T1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tube1Q9D6T1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tube1Q9D6T1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tube1Q9D6T1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms