Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6P8

Calml3, Calmodulin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml3Q9D6P8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Calml3Q9D6P8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Calml3Q9D6P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Calml3Q9D6P8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Calml3Q9D6P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms