Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930449I24RikQ9D5E3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4930449I24RikQ9D5E3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4930449I24RikQ9D5E3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
4930449I24RikQ9D5E3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4930449I24RikQ9D5E3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms