Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcc1Q9D4H2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gcc1Q9D4H2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gcc1Q9D4H2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gcc1Q9D4H2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Gcc1Q9D4H2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms