Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam90a1bQ9D4F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam90a1bQ9D4F3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam90a1bQ9D4F3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam90a1bQ9D4F3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms