Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Clvs1Q9D4C9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Clvs1Q9D4C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Clvs1Q9D4C9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms