Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph14Q9D3W1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rsph14Q9D3W1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rsph14Q9D3W1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rsph14Q9D3W1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rsph14Q9D3W1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms