Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd2Q9D3B1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacd2Q9D3B1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hacd2Q9D3B1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacd2Q9D3B1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms