Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erp44Q9D1Q6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Erp44Q9D1Q6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Erp44Q9D1Q6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Erp44Q9D1Q6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Erp44Q9D1Q6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms