Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TbcbQ9D1E6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TbcbQ9D1E6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TbcbQ9D1E6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TbcbQ9D1E6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms