Protein–RNA interactions for Protein: Q9D131

UPF0686 protein C11orf1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D131 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D131 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D131 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D131 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D131 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D131 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D131 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9D131 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D131 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D131 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D131 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D131 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D131 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D131 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D131 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D131 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D131 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D131 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D131 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D131 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D131 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D131 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D131 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D131 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D131 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D131 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D131 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D131 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D131 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D131 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D131 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D131 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D131 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D131 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D131 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D131 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D131 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D131 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D131 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D131 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D131 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D131 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D131 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D131 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D131 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D131 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms