Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zbed3Q9D0L1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zbed3Q9D0L1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zbed3Q9D0L1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zbed3Q9D0L1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zbed3Q9D0L1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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