Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf146Q9CZW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rnf146Q9CZW6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf146Q9CZW6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf146Q9CZW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms