Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp1Q9CZP0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ufsp1Q9CZP0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ufsp1Q9CZP0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.2 ms