Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmem39aQ9CYC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmem39aQ9CYC3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmem39aQ9CYC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmem39aQ9CYC3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmem39aQ9CYC3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmem39aQ9CYC3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms