Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Exo5Q9CXP9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Exo5Q9CXP9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Exo5Q9CXP9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms