Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CXL3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CXL3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Q9CXL3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Q9CXL3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CXL3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Q9CXL3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CXL3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CXL3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Q9CXL3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CXL3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9CXL3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CXL3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CXL3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9CXL3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Q9CXL3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CXL3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CXL3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CXL3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9CXL3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms