Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Malsu1Q9CWV0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Malsu1Q9CWV0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms