Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cnot11Q9CWN7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cnot11Q9CWN7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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