Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Smurf1Q9CUN6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smurf1Q9CUN6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smurf1Q9CUN6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Smurf1Q9CUN6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smurf1Q9CUN6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf1Q9CUN6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf1Q9CUN6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms