Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rpl39lQ9CQD0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpl39lQ9CQD0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rpl39lQ9CQD0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpl39lQ9CQD0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rpl39lQ9CQD0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl39lQ9CQD0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rpl39lQ9CQD0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rpl39lQ9CQD0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rpl39lQ9CQD0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl39lQ9CQD0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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