Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trappc5Q9CQA1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trappc5Q9CQA1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trappc5Q9CQA1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trappc5Q9CQA1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms