Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med21Q9CQ39 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Med21Q9CQ39 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med21Q9CQ39 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med21Q9CQ39 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med21Q9CQ39 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms