Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rnaseh2cQ9CQ18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnaseh2cQ9CQ18 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms