Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ11

2010109I03Rik, RIKEN cDNA 2010109I03, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010109I03RikQ9CQ11 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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2010109I03RikQ9CQ11 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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2010109I03RikQ9CQ11 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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2010109I03RikQ9CQ11 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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2010109I03RikQ9CQ11 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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2010109I03RikQ9CQ11 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2010109I03RikQ9CQ11 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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2010109I03RikQ9CQ11 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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2010109I03RikQ9CQ11 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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2010109I03RikQ9CQ11 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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2010109I03RikQ9CQ11 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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2010109I03RikQ9CQ11 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2010109I03RikQ9CQ11 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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2010109I03RikQ9CQ11 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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2010109I03RikQ9CQ11 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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2010109I03RikQ9CQ11 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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2010109I03RikQ9CQ11 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2010109I03RikQ9CQ11 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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2010109I03RikQ9CQ11 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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