Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rwdd4Q9CPR1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rwdd4Q9CPR1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rwdd4Q9CPR1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms