Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ino80bQ99PT3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ino80bQ99PT3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ino80bQ99PT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ino80bQ99PT3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ino80bQ99PT3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms