Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Krt23Q99PS0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Krt23Q99PS0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt23Q99PS0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt23Q99PS0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms