Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE8

Abcg5, ATP-binding cassette sub-family G member 5, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg5Q99PE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Abcg5Q99PE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Abcg5Q99PE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcg5Q99PE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcg5Q99PE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.5 ms