Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Acss1Q99NB1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Acss1Q99NB1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acss1Q99NB1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Acss1Q99NB1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acss1Q99NB1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acss1Q99NB1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Acss1Q99NB1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Acss1Q99NB1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Acss1Q99NB1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms